Hay muchas diferencias entre el Toyota Prius y el Honda Civic híbrido. Los puntos dominantes son: Prius utiliza una tecnología llamada Toyota Hybrid System (THS o Sistema Híbrido de Toyota) que cambia automáticamente entre la gasolina y la electricidad según las necesidades de manejo. El "Honda Integrated Motor Assist" utiliza un sistema híbrido paralelo básico con un motor eléctrico.

Diferente al Honda Civic Híbrido, Prius fue construido desde un principio como un verdadero vehículo híbrido; su carrocería, chasis e interior se construyeron pensando en las necesidades únicas de un híbrido. Prius alcanza números más bajos en emisiones. Prius provee cerca de un 75% menos emisiones que el Honda Civic híbrido. Prius esta clasificado como un SULEV  (vehículo súper ultra bajo en emisiones) comparado al Honda Civic híbrido ULEV (vehículo ultra bajo en emisiones).